Vena universitetidan doktor Arindam Ghatak turli stressli vaziyatlarga javoban kartoshka proteomasidagi o‘zgarishlarning (mavjud barcha oqsillar yig‘indisi) xolis keng qamrovli rasmini olish uchun Desiree kartoshka navining yuqori samarali proteomik profilini o‘tkazdi.
Oʻsimliklar loyiha hamkori boʻlgan Chexiya Respublikasida joylashgan PSI kompaniyasida tajriba tajribasida yetishtirildi.
Barcha oqsillar sindirilgunga qadar ushbu murakkab tekshiruv uchun ajratilgan va oldindan fraksiyalangan va massa spektrometriyasiga duchor bo'lgan, bu bitta namunada yuzlab turli xil oqsillarni aniqlash va qo'shimcha ravishda ularning ko'pligini aniqlash imkonini beradi. Keyin to'plangan ma'lumotlarni tahlil qilish uchun Proteome Discoverer dasturidan foydalanildi (Thermo, Germaniya). Proteinlar Solanum ichki ma'lumotlar bazasi yordamida aniqlangan (NIB instituti, Lyublyana, Sloveniya).
O'rim-yig'im 1 (stressdan bir kun keyin) va 3 hosildan jami 10341 ta oqsil topildi (stressdan 8 kun o'tgach). O'rim-yig'im 1da botqoqlanish stressi eng yuqori proteom modulyatsiyasi kuzatilgan. Bu erda signalizatsiya, lipid metabolizmi va RNK bilan bog'lanishda ishtirok etadigan oqsillar nazorat bilan solishtirganda faollikni ko'rsatdi. Xuddi shunday, nazorat bilan solishtirganda issiqlik stressi paytida, fotosintez va ikkilamchi metabolizmda ishtirok etadigan oqsillar ko'payib, proteomning stressga javob mexanizmini ochib berdi.
O'rim-yig'im 1 bilan bir qatorda, 3 o'rim-yig'im ham botqoqlanish stressi, issiqlik va issiqlik va qurg'oqchilikning birgalikdagi ta'siri proteomning eng kuchli regulyatsiyasini aniqlaydigan stresslar ekanligini ko'rsatdi. Boshqaruv va boshqa stresslar bilan solishtirganda, energiya almashinuvining funktsional toifasiga kiruvchi oqsillarga ta'sir qiluvchi botqoqlanish stressi ostida 14-3-3 signalizatsiyasi ko'tarildi.
"Dastlabki aniqlashga ko'ra, botqoqlanish va issiqlik stressi boshqa stresslarga nisbatan proteom darajasida eng kuchli tartibga solishni ko'rsatdi. Biroq, boshqa o'rim-yig'im vaqtlari bilan solishtirganda, ayniqsa qurg'oqchilik stressi paytida, tiklanish bosqichining proteomini ko'rib chiqish qiziqarli bo'ladi. O'simliklarning stressga javob berish mexanizmlari va kartoshkaning Desiree navidagi tiklanish bosqichi haqida chuqur ma'lumot olish uchun ko'proq ma'lumotlar qazib olish davom etmoqda ", deb yozadi olimlar.
Europatat ishtirok etayotgan "Horizon 2020" EI loyihasi "Ko'p stressga chidamli Ant PoTato" (ADAPT) ning tezlashtirilgan rivojlanishi kartoshkani kelajakdagi qiyin o'sish sharoitlariga moslashtirish uchun yangi strategiyalarni ishlab chiqishga qaratilgan.
Loyihaning asosiy maqsadlaridan biri kartoshkaning morfologik, fiziologik, biokimyoviy va molekulyar o'zgarishlarini yuqori o'tkazuvchanlik fenotiplash va OMICS texnologiyalarini (genomika, transkriptomika, proteomika yoki metabolizm).