Synchytrium endobioticum kartoshka siğili kasalligini keltirib chiqaradi. Synchytrium endobioticum obligat parazit boʻlib, gifa hosil qilmaydi, balki harakatchan zoosporalarni oʻz ichiga olgan sporangiya hosil qiladi. Yozgi sporangiyalar yupqa devorli va qisqa umr ko'radi. Ular kartoshka to'qimalarida hosil bo'lib, yangi zoospora infektsiyalarini keltirib chiqaradi. Dam oluvchi sporalar (ba'zan qishki sporangiya, qishki spora, dam oluvchi sori yoki qishki sori deb ham ataladi) qalin devorli bo'lib, uy egasi bo'lmagan taqdirda ham juda uzoq vaqt davomida hayotiyligini saqlab qoladi. Ular butun vegetatsiya davrida ishlab chiqarilishi mumkin. Ular siğillarning parchalanishidan tuproqqa chiqariladi. S. endobioticum diagnostikasi siğil paydo boʻlishi mumkin boʻlgan oʻsimlikka ham, tuproqqa ham tegishli.
dam oladigan sporalarni olib yuradi.
Ko'p patotiplar (irqlar) tasvirlangan S. endobioticum Bular differentsial kartoshka navlaridagi virulentligi bilan belgilanadi. 1-patotip (D1) hozirda Yevropada kartoshkani yuqtirishi haqida kamdan-kam xabar berilgan, chunki kartoshka navlari unga sezgir emas, bu, aftidan, xo'jayin organizmida dominant qarshilik mavjudligi bilan bog'liq. Boshqa patotiplar endi G'arbiy Yevropada tez-tez uchraydi va ayniqsa Markaziy va Sharqiy Yevropaning yomg'irli tog'li hududlarida uchraydi. Ular Yevropadan tashqarida ham uchraydi (masalan, Nyufaundlend, Kanada va Turkiyaning Osiyo qismida). Bu patotiplarga qarshilik kam uchraydi, shuning uchun ularni nazorat qilish qiyinroq. 1(D1) dan boshqa patotiplar ma'lum kartoshka navlariga differentsial virulentlik orqali farqlanadi, ammo aks holda 1(D1) patotipiga qaraganda bir-biri bilan chambarchas bog'liq ko'rinadi. Tavsiya etilgan ichki choralar EPPO mamlakatlar patotiplarni aniqlashni talab qiladi.
Mikroskop ostida kuzatilgan yozgi sporangiya yoki dam olish sporalarining identifikatori an'anaviy PCR bilan tasdiqlanishi mumkin,
va real vaqtda PCR. An'anaviy PCR ribosoma DNK mintaqasining (ITS) ichki transkripsiyalangan ajratgichiga asoslangan bo'lib, oldingi primer ITS1 ga va teskari primer ITS2 ga tavlanadi. Van Gent-Pelzer va boshqalarning real vaqtda PCR. (2010) ITS2 ga asoslangan. Smit va boshqalarning real vaqtda PCR. (2014) bu erda tasvirlangan kichik subunit (SSU) ribosomaga asoslangan
DNK (18S rDNK). Bonants va boshqalar tomonidan ishlab chiqilgan real vaqtda PCR. (2015) Polimorfik ketma-ketliklarning murakkabligini kamaytirish (CRoPS) tahlili yordamida aniqlangan 1 (D1) bilan bog'liq yagona nukleotidli polimorfizm (SNP) patotipiga asoslangan. Kartoshka siğili materialidan foydalanganda, DNK izolyatsiyasining samaradorligini kuzatish uchun o'simlik COX geniga qaratilgan ichki ijobiy izolyatsiya nazorati qo'llaniladi. 1 (D1) patotipini hech bo'lmaganda 2 (G1), 6 (O1) va 18 (T1) patotiplaridan real vaqtda PCR yordamida ajratish mumkin.
Malumot: PM 7/28 (2) Synchytrium endobioticum. EPPO Axborot byulleteni, 47: 420–440. https://doi.org/10.1111/epp.12441
