EuroBlight loyihasi kartoshkaning kech blightining davom etayotgan evolyutsiyasini o'rganmoqda patogen (Phytophthora infestans).
2017 yilda Yevropaning 1500 mamlakatidan 16 ga yaqin namuna genotiplangan.
Natijalar shuni ko'rsatadiki, yangi klonlar tarqalishda davom etmoqda.
Eng so'nggi topilmalar
Namunalarning taxminan 75% oldingi mavsumlarda ham kuzatilgan aniqlangan klonal nasllarga tegishli.
Ba'zi klonlar keng tarqalgan va Evropada o'n yildan ko'proq vaqt davomida mavjud, ammo uchta yangi paydo bo'lgan klonlar (EU_37_A2, EU_36_A2 va EU_41) ularning umumiy chastotasini 10 yildagi 2016% dan 28 yilda aholining 2017% gacha oshirdi.
Xuddi shu davrda 13_A2 genotipi populyatsiyaning 30% dan 20% dan kamiga kamaydi.
Aholining to'rtdan bir qismi, asosan, Yevropaning shimoliy qismidan, oospora inokulumiga mos keladigan efemer, genetik jihatdan xilma-xil izolatlardan iborat. Evropada klonlarning jinsiy rekombinantlarga nisbatan ustunligida aniq mintaqaviy naqsh kuzatildi.
Ushbu siljishlarning ba'zi oqibatlari va davom etayotgan o'zgarishlar muhokama qilinadi.
Metodologiya
O'n to'qqizinchi asrda kelganidan beri, Phytophthora infestans, kartoshkaning kech blight sababi, Evropa kartoshka ishlab chiqarish uchun jiddiy tahdid bo'lib qolmoqda. Hozir biz kasallikni nazorat qilish uchun o'tmishdagiga qaraganda yaxshiroq jihozlangan bo'lsak-da, rivojlanayotgan patogen populyatsiyalar integratsiyalashgan boshqaruv amaliyotiga qarshi turishda davom etmoqda.
Evropa, Amerika va Osiyoda kech blightni keltirib chiqaradigan P. infestans populyatsiyalarida tez o'zgarishlar, shu jumladan agressivligi kuchaygan yoki fungitsidlarga sezgirligi pasaygan shtammlarning paydo bo'lishi kuzatilgan. Darhaqiqat, P. infestans populyatsiyalaridagi o'zgarishlar chidamli navlarni ishlab chiqish va joylashtirishga, kasalliklardan ogohlantirish tizimlarining ishlashiga va o'simliklarni himoya qilish vositalarining samaradorligiga bevosita ta'sir qiladi.
(Kattalash uchun bosing)
Euroblight ma'lumotlar bazasiga kiritilgan kech blight holatiga misol
Shu sababli, muvofiqlashtirilgan va uzluksiz patogen monitoringi EuroBlight konsorsiumi tomonidan 2013 yildagi yig'ilishida taklif qilingan va hozirda barcha manfaatdor tomonlarni o'z ichiga olgan Evropa Ittifoqi miqyosida monitoring faoliyati sifatida amalga oshirilmoqda.
IPM strategiyasini optimallashtirishga yordam berish uchun biz populyatsiyalarni kuzatishni va invaziv genotiplarni tavsiflashni davom ettiramiz. Evropa Ittifoqining 2009/128 / EC-sonli yo'riqnomasi o'simliklarni himoya qilish vositalaridan barqaror foydalanish bo'yicha.
Hafta kunlari. Bir marta bosish orqali obunani bekor qiling.
FTA kartasining yagona namunasi. FTA kartalari odatda DNK namunalarini olish va saqlash uchun ishlatiladi.
O'tgan yillardagidek, "FTA kartalari" butun sanoat bo'ylab kasallik "skautlari" ga tarqatildi, ular blight bilan kasallangan ekinlarga tashrif buyurdilar. Kasal barglar kartochkalarga bosildi va Jeyms Xatton instituti va INRA Rennesda patogen DNK barmoq izlari olingan laboratoriyalarga qaytarildi. DNK barmoq izi ma'lumotlari patogenning klonal nasl-nasabini aniqlaydi va Evropa bo'ylab xilma-xillikni aniqlash uchun geo-joylashuv ma'lumotlari bilan birlashtiriladi. 2017 yilda kasallik bosimi 2016 yilga nisbatan pastroq bo'lib, bu namuna olish chastotasi va tarqalishini biroz qisqartirdi.
1500 ga yaqin namunalar Yevropaning 20 mamlakatidagi 16 dan ortiq hamkorlar tomonidan to‘plangan. O'tgan yillardagidek, Buyuk Britaniyadagi (GB) ekinlardan olingan AHDB Kartoshkaning "Blightga qarshi kurash" kampaniyasi ma'lumotlari kiritilgan. Hamkorlarning ma'lumotlari ham kiritilgan IPMBlight2.0 loyihasi, bu IPM strategiyalarini qo'llab-quvvatlash uchun patogen fenotip ma'lumotlarini ham ishlab chiqaradi. 2013-2017 yillardagi jamlangan ma'lumotlar hozirda 6347 mamlakatdan 34 dan ortiq namunalarni o'z ichiga oladi. Xalqaro guruhlar koʻmagida Osiyo, Janubiy Amerika va Shimoliy Afrikaning ayrim qismlari uchun ham maʼlumotlar kiritildi.
Topilmalar
So'nggi besh yil ichida aholining 60-79% har mavsumda takrorlanadigan ma'lum klonal nasllardan iborat. Qolgan namunalar yangi, genetik jihatdan xilma-xil genotiplar bo'lib, asosan bir mavsumda bir joyda topilgan va "Boshqa" (quyida) deb nomlangan toifaga guruhlangan.
(Interaktiv ma'lumotlar bazasiga kirish uchun bosing)
2017-yilda EuroBlight namunalarida Yevropa bo‘ylab topilgan Phytophthora infestans genotiplarining xaritasi. Ushbu xaritaning interaktiv versiyasiga kirish uchun rasmga bosing. (Euroblight 2018)
2017-yilda EU_13_A2 (ko‘k-13) kloni namunalarning 31% dan 19% gacha kamaydi, bu birinchi marta EU_6_A1 (23%) dan past bo‘ldi.
Agressiv EU_13_A2 klonining global tarqalishi va uning metallaksilga chidamliligi Yevropa, Osiyo va Shimoliy Afrikaning baʼzi qismlarida boshqaruv samaradorligiga taʼsir qilishda davom etmoqda va IPMning eng yaxshi amaliyotlarini qoʻllab-quvvatlash uchun patogen maʼlumotlarga boʻlgan ehtiyojni kuchaytirmoqda.
EU_6_A1 chastotasi barqaror edi, lekin bu klon GB, Fransiya va Belgiyadan olingan bitta namunada lokalizatsiya qilingan.
EU_1_A1 chastotasi aholining 4.5% dan 2.2% gacha kamaydi va EU_6_A1 bilan bir xil mamlakatlarda topildi.
Uchta yangi klon yuqoridagi genotiplarni siqib chiqardi va 2017 yilda ularning oralig'ini oshirdi.
- Genotip EU_36_A2 Birinchi marta 2014 va 2015 yillarda Germaniya va Gollandiyadagi kraxmalli kartoshka hududlarida past chastotalarda namuna olingan.
2016 va 2017 yillarda uning kasallanishi aholining 3.7% dan 8.8% gacha ko'tarildi va u Niderlandiya bo'ylab Belgiya, GB, Daniya va Polshaga tarqaldi. - Genotip EU_37_A2 birinchi marta 2013 yilda Gollandiyaning Noordoostpolder shahrida aniqlangan va 2014 va 2015 yillarda past chastotada mahalliy bo'lib qoldi.
U 5.5 yilda tanlab olingan aholining 2016% ga ko'paydi va 2017 yilda 14.4% ga yetdi, shuningdek, Angliya, Belgiya va Shimoliy Frantsiyada o'rnatildi. - Genotip EU_41 birinchi marta 2013 yilda Daniyada qayd etilgan.
Endi u 4.5 yil aholisining 2017 foizini tashkil etib, havodan tarqalish bilan mos ravishda Norvegiya va Shvetsiyaning janubiga va Polshaning shimoliga tarqaldi. EU_41 ulanish turi sinovi kutilmoqda.
Ushbu klonlarning omon qolishi va tarqalishi, boshqalari kamayib borayotgan yoki o'rnatolmagan bo'lsa, ular evolyutsion jihatdan mos ekanligini va kasalliklarni nazorat qilishda qiyinchiliklarga olib kelishi mumkinligini ko'rsatadi.
Fluazinamga sezuvchanlik pasaygan 37 yilda Wageningen universiteti tomonidan EU_2_A2017 da xabar qilingan, ya'ni boshqaruv amaliyotiga ta'sir qiladi. Biroq, boshqa klonlarning fungitsid faol moddalariga sezgirligi haqida hali hech qanday ma'lumot yo'q.
Nihoyat, genetik jihatdan xilma-xil "Boshqa" namunalari aholining 25% ni tashkil etdi va Evropaning sharqiy va shimoli-sharqida eng yuqori chastotada qoldi. Ba'zi klonlardan farqli o'laroq, "Boshqa" izolatlar va boshqa klonlarga ega bo'lgan xususiyatlar hali ma'lum emas. Biroq, IPMBlight2.0 loyihasi kech blightni boshqarish va prognozlashni yaxshilashga yordam berish uchun klonal va jinsiy rekombinant izolatlarning xususiyatlarini batafsil o'rganishni boshladi.
2017 yilgi populyatsiyaning genetik xilma-xilligini EuroBlight patogen ma'lumotlar bazasiga bog'langan tahlil vositasi (poppr 2.0) yordamida ko'rish mumkin. Minimal kengaytmali tarmoq (quyida) 2017 yilgi populyatsiya tarkibini ko'rsatadi, faqat aniqlangan klonlarni o'z ichiga oladi. 13 yoshli EU_13_A2 naslida "yosh" klonlarga nisbatan sezilarli subklonal xilma-xillik kuzatiladi. "Boshqa" izolatlar (ko'rsatilmagan) genetik jihatdan xilma-xil va butun tarmoq bo'ylab tarqalgan. Ushbu vositalar yordamida aholi o'zgarishini o'rganish uchun batafsil tahlillar olib borilmoqda.
(Kattalash uchun bosing)
2017 yilgi genetik xilma-xillik Fitoftora infestansi poppr 2.0 bilan tasvirlangan aholi soni (minimal tarmoqli tarmoq)
Patogenni kuzatishning EuroBlight modeli Evropa miqyosida patogen evolyutsiyasini tushunish uchun tezkor, tejamkor va muvofiqlashtirilgan yondashuvdir. Dominant klonlar haqidagi ma'lumotlar ishlab chiqaruvchilar, maslahatchilar, selektsionerlar va agrokimyo kompaniyalariga boshqaruv bo'yicha amaliy maslahatlar berish va uzoq muddatli strategiyalarni shakllantirish uchun uzatildi. Ma'lumotlar yangi klonlarning paydo bo'lishi va tarqalishi haqida erta ogohlantirishni ta'minlaydi, bu esa sanoatdan o'z vaqtida javob berishga imkon beradi.
EuroBlight tarmog'i Amerika va Osiyodagi boshqa tarmoqlar bilan usullarni uyg'unlashtirishda davom etmoqda va ma'lumotlar bazasi va global miqyosda ogohlikni yaxshilash va zararkunandalarga qarshi kurash vositalaridan foydalanish uchun kech blightni boshqarish bilan shug'ullanadigan guruhlar o'rtasidagi doimiy hamkorlikni rag'batlantiradi.
